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拨打电话时会有短信回复的原因可能有以下几种情况。
1、对方设置了电话与手机的呼叫转移功能，当电话无法接听或正在忙碌时，会自动转移到短信箱，收到短信回复提示。
2、网络电话通过运营商的服务器发送短信通知对方有未接来电，这种网络电话的通话记录和短信通知功能可能独立于手机本身的通话功能，即使对方没有接听电话，也能通过短信通知对方有未接来电的记录。
3、对方使用了某些特殊软件或功能，如未接听时的自动回复短信功能等，这些软件或功能会根据用户的设置自动发送短信回复。
情况仅供参考，具体原因还需要根据实际情况判断，如果对这种情况感到疑惑，可以尝试直接联系对方沟通了解具体原因。